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        1. 上海anti Flag免疫沉淀選磁珠還是瓊脂糖珠

          來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2024-07-31

          免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation,簡(jiǎn)稱IP)是一種生物學(xué)實(shí)驗(yàn)方法,用于從細(xì)胞或組織裂解物中分離和純化特定蛋白質(zhì)。這項(xiàng)技術(shù)依賴于抗體的高度特異性,通過(guò)抗體與目標(biāo)蛋白質(zhì)的結(jié)合,實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)蛋白質(zhì)的富集和純化。
          具體操作步驟通常包括以下幾個(gè)階段:裂解細(xì)胞或組織,抗體與蛋白質(zhì)結(jié)合,固相支持物的使用,免疫復(fù)合物的捕獲,洗滌,洗脫分析。
          免疫沉淀技術(shù)不僅可以用于檢測(cè)蛋白質(zhì)的存在和量,還可以用于研究蛋白質(zhì)的翻譯后修飾、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及蛋白質(zhì)的功能等。此外,免疫沉淀技術(shù)是許多其他高級(jí)實(shí)驗(yàn)技術(shù)的基礎(chǔ),如染色質(zhì)免疫沉淀測(cè)序(ChIP-Seq)和蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析等。
          免疫沉淀技術(shù)Co-IP的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。上海anti Flag免疫沉淀選磁珠還是瓊脂糖珠

          上海anti Flag免疫沉淀選磁珠還是瓊脂糖珠,免疫沉淀

          免疫沉淀純化所得抗原量低有多種原因,
          A. 純化所得抗原量低
          1. 抗原結(jié)合水平低
          IP 應(yīng)用中出現(xiàn)低抗原結(jié)合水平的可能原因有很多,結(jié)合反應(yīng)所使用的溶液是重要原因之一。必須使用適合的緩沖液,有特定的pH和鹽濃度,可能還需要添加互作所需的輔助因子。IP 或Co-IP 中用于純化的抗體是影響得率的另一個(gè)重要因素。如果抗體本身易失活或與抗原結(jié)合微弱,則可能很難找到足夠溫和的條件,即能產(chǎn)生結(jié)合,又能保證在孵育和洗滌過(guò)程中結(jié)合可以穩(wěn)定保持。
          2. 抗原洗脫水平低
          在某些情況下,抗原與抗體或結(jié)合蛋白結(jié)合之間可能會(huì)發(fā)生極強(qiáng)的相互作用,傳統(tǒng)的洗脫緩沖液無(wú)法將其破壞。如果需要使用溫和洗脫緩沖液收集功能性抗原,則上述矛盾尤為突出。

          上海ChIP免疫沉淀磁珠原理免疫沉淀技術(shù)RIP的應(yīng)用有哪些?

          上海anti Flag免疫沉淀選磁珠還是瓊脂糖珠,免疫沉淀

          免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)通常包括以下幾個(gè)關(guān)鍵步驟:

          1. 目標(biāo)蛋白質(zhì)的選擇:
          2. 抗體的選擇:選擇特異性強(qiáng)、親和力高的抗體來(lái)捕獲目標(biāo)蛋白質(zhì)
          3. 樣本的準(zhǔn)備:收集和準(zhǔn)備細(xì)胞或組織樣本。
          4. 蛋白質(zhì)的裂解和釋放:選擇合適的裂解條件,如pH值、離子強(qiáng)度、去污劑等。
          5. 蛋白質(zhì)濃度的測(cè)定:確定裂解液中蛋白質(zhì)的濃度,以便于后續(xù)步驟的標(biāo)準(zhǔn)化。
          6. 免疫沉淀的操作:將特異性抗體與裂解液混合,并在適宜的條件下孵育,以形成抗體-抗原復(fù)合物。
          7. 非特異性結(jié)合的減少:通過(guò)預(yù)純化步驟去除可能的非特異性結(jié)合蛋白。
          8. 洗滌:多次洗滌以去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和雜質(zhì)。
          9. 目標(biāo)蛋白質(zhì)的洗脫:使用適當(dāng)?shù)木彌_液洗脫抗體-抗原復(fù)合物。
          10. 后續(xù)分析:對(duì)洗脫的蛋白質(zhì)進(jìn)行進(jìn)一步分析,如Western Blot.
          11. 對(duì)照實(shí)驗(yàn):設(shè)計(jì)適當(dāng)?shù)恼龑?duì)照和負(fù)對(duì)照,以評(píng)估實(shí)驗(yàn)的特異性和敏感性。

          免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)是一種利用抗體與特定蛋白質(zhì)結(jié)合的特性,從復(fù)雜樣本中分離和純化目標(biāo)蛋白質(zhì)的實(shí)驗(yàn)方法。這項(xiàng)技術(shù)在生物醫(yī)學(xué)研究中有著廣泛的應(yīng)用場(chǎng)景,以下是一些主要的應(yīng)用領(lǐng)域:
          1. 蛋白質(zhì)相互作用分析:通過(guò)免疫沉淀技術(shù),研究人員可以研究蛋白質(zhì)之間的相互作用,揭示蛋白質(zhì)復(fù)合物的組成以及它們?cè)诩?xì)胞內(nèi)的功能和調(diào)控機(jī)制。
          2. 抗體藥物開發(fā):免疫沉淀技術(shù)可以用于研究抗體藥物與其靶標(biāo)蛋白的結(jié)合特性,評(píng)估抗體藥物的親和力和特異性,指導(dǎo)抗體藥物的設(shè)計(jì)和優(yōu)化。
          3. 蛋白質(zhì)表達(dá)水平分析:通過(guò)比較不同條件下的免疫沉淀結(jié)果,可以評(píng)估目標(biāo)蛋白的相對(duì)量,進(jìn)而研究蛋白質(zhì)的表達(dá)調(diào)控。
          4. 染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP):這是一種特殊的免疫沉淀技術(shù),用于研究蛋白質(zhì)與DNA的相互作用,如轉(zhuǎn)錄因子或組蛋白修飾與基因組特定區(qū)域的結(jié)合情況。
          5. RNA免疫沉淀(RIP):類似于ChIP,RIP用于研究RNA結(jié)合蛋白與RNA分子之間的相互作用。
          免疫沉淀技術(shù)ChIP的原理是什么?

          上海anti Flag免疫沉淀選磁珠還是瓊脂糖珠,免疫沉淀

          “免疫沉淀”一般是指采用固定在固相支持物上的結(jié)合蛋白,進(jìn)行小規(guī)模的蛋白質(zhì)親和純化的實(shí)驗(yàn)。更確切地說(shuō),IP是采用固定在微珠支持物(一般是瓊脂糖樹脂)上的特定抗體,從復(fù)雜的混合物中,純化單一抗原的實(shí)驗(yàn)。固定化蛋白質(zhì)復(fù)合物的組裝既可以分步進(jìn)行,也可以一步完成。

          常見的加樣順序:抗體和樣本(如細(xì)胞裂解物)一起孵育,然后加入親和微珠,用于捕獲抗體-抗原復(fù)合物。也可以將抗體和微珠(通過(guò)抗體結(jié)合蛋白,如蛋白A、G或A/G等,直接或間接結(jié)合抗體)先進(jìn)行孵育,然后再加入含有抗原的樣本。當(dāng)抗原、抗體和固相支持物產(chǎn)生結(jié)合以后,充分洗滌微珠,再采用適當(dāng)?shù)南疵摼彌_液從支持物上洗脫抗原。
          免疫沉淀選瓊脂糖珠還是磁珠?上海ChIP免疫沉淀磁珠原理

          免疫沉淀IP技術(shù)選瓊脂糖珠還是磁珠?上海anti Flag免疫沉淀選磁珠還是瓊脂糖珠

          RIP實(shí)驗(yàn)步驟通常包括:
          1. 細(xì)胞收集與交聯(lián):培養(yǎng)細(xì)胞至適當(dāng)密度。使用交聯(lián)劑(如甲醛)進(jìn)行交聯(lián),以固定蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物。
          2. 細(xì)胞裂解:收集細(xì)胞并進(jìn)行裂解,釋放RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物。在裂解過(guò)程中添加蛋白酶抑制劑以防止蛋白質(zhì)降解。
          3. 超聲處理:使用超聲波破壞細(xì)胞,獲得更小的染色質(zhì)片段,這有助于后續(xù)步驟中抗體的接觸。
          4. 除去細(xì)胞碎片:通過(guò)離心去除細(xì)胞碎片和未裂解的細(xì)胞,收集含RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物的上清液。
          5. 免疫沉淀:將針對(duì)特定RNA結(jié)合蛋白(RBP)的抗體加入到上清液中。孵育一段時(shí)間,使抗體與目標(biāo)蛋白充分結(jié)合。
          6. 捕獲免疫復(fù)合物:添加蛋白A或蛋白G結(jié)合的磁珠或瓊脂糖珠。孵育使抗體-蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物與珠子結(jié)合。
          7. 洗滌:多次洗滌珠子以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)和RNA。
          8. 洗脫與逆轉(zhuǎn)交聯(lián):使用適當(dāng)?shù)木彌_液洗脫免疫復(fù)合物。使用蛋白酶K處理樣品以逆轉(zhuǎn)交聯(lián),釋放RNA。
          9. RNA提取與純化:從免疫沉淀樣品中提取RNA,并進(jìn)行純化。
          10. RNA分析:使用qPCR、Northern blot、RNA-Seq等方法分析沉淀的RNA,以確定與目標(biāo)蛋白相互作用的RNA種類。
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          標(biāo)簽: 支原體 免疫沉淀
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